Podrías revisar la documentación del manual oficial de PHP sobre el tema de "arrays" .. verás que hay un buen montón de funciones para trabajar con arrays .. entre ellas:
array_diff()
que te devuelve un array con los elementos que no se repiten ..
Y .. array_intersect() por mecionar un par de funciones que te pueden servir .. Tal vez exista alguna mejor por eso te invito a leer la documentación antes de probar soluciones clásicas tipo "bucles anidados que lee tus array y comparan (IF) sus elementos ..".
más info:
http://www.php.net/manual/en/ref.array.php
Un saludo,