pues no se como las estas cargando pero te recomiendo que hagas un movieclip vacio y le asignes un nombre, por ejemplo 'micargador' ahora la accion en el frame donde vayas a cargar tu swf:
Código:
loadMovie("elarchivo1.swf",elcargador);
si vas a cargar solo un clip a la vez.. cada vez que vayas a cargar otra haces lo mismo
Código:
loadMovie("elarchivo2.swf",elcargador);
y asi no vas a tener problemas