Hola nafw,
no se puede. Sólo se pueden controlar las barras de herramientas etc al abrir una ventana nueva mediante javascript. A una ventana que yá está abierta no se le puede dar control a estos aspectos.
Lo único que puedes controlar es sus dimensiones usando un resizeTo() pero eso sólo sirve en el caso de que la ventana no esté maximizada
