Hola,
Emule es opensource, asi que tienes el codigo fuente para ver que es lo que realmente hace. Usa la red P2P de edonkey y overture, y no se si piensan implementar alguna mas.
Bittorrent creo que tambien es open source.
the_anzwer, como dice dazuaga, los programas P2P no son ilegales. Lo ilegal es compartir y bajarse ficheros que violan los derechos de autor (o copyrights). Es lo mismo que pasa con los programas de grabacion de CD/DVD, o con los rippers, o con los programas de envio masivo de emails, o con los cuchillos (son legales, lo ilegal es rebanar el cuello a alguien).
Las redes P2P son una alternativa a tener que mantener un servidor FTP para que soporte muchisimo trafico, u organizar un sistema de mirrors.
Asi que no confundamos terminos. Soy el primero en criticar la pirateria, pero tengo claro que las redes P2P no son ilegales.
Eso si, dazuaga, ¿no crees que hubiese sido mas adecuado poner la pregunta en el foro de software?
Saludos.