Vamos a ver si comprendo....
Si al refererirte "gestionar" es darle mantenimiento, como backup, no le va a pasar nada a los datos del o de los usuarios conectados en ese momento. Una de las ventajas de las BD es que no interfieren con lo que está haciendo el usuario. Donde podrías tener problemas es al restaurar la BD en otro lado porque no estarían contemplados los datos de esos usuarios que quedaron en espera.
Entre las herramientas básicas de los motores de BD estan los de bloquear completamente la BD, este proceso se puede hacer de varias formas.
Fijate en este mensaje de los foros...
Concurrencia y semaforos