Puedes gestionar el buffer de salida de PHP con las funciones ob_xxx()
Ejemplo:
Código PHP:
<?
// Comienzo la captura del buffer de salida de PHP.
ob_start();
?>
<html>
<head>
</head>
<body>
<?
// Tu consulta a tu BD que genera su salida en HTML ...
?>
</body>
</html>
<?
// Me guardo lo que tenga el buffer de salida en una variable.
$html=ob_get_contents();
// se termina de "capturar" el buffer de salida.
ob_end_clean();
// En $html ya tienes tu html generado .. puedes llevarlo a un archivo simplemente con fwrite() (previo uso de fopen() donde definiras el modo de escritura y el nombre del archivo.html )
?>
Una observación .. La parte de HTML que generéras dinámicamente con PHP .. usa saltos de línea \n en cada línea de código HTML que generes .. así lo veras tal cual (con sus saltos de línea) si editas ese código HTML con un editor o simplemente en tu navegador ver -> código fuente )
Un saludo,