Creo que lo haces igual que si pasaras de AVI a VCD, lo único es que tienes que tener los codec MPEG-2 instalados, estos:
http://www.mundodivx.com/descargas.php?id=32
La única dificultad es evitar que te queden bandas negras laterales, lo cual suele suceder cuando pasas de SVCD a VCD. Eso lo puedes arreglar usando los controles de Aspect Ratio o de dimensiones de imagen que tengas en el programa que vayas a usar.