Ok, perfecto.
Lo hice asi:
var table= document.getElementById("table")
trs= table.firstChild.childNodes
var tr1= trs[0].cloneNode(true)
var tr2= trs[1].cloneNode(true)
table.firstChild.replaceChild(tr1, trs[1])
table.firstChild.replaceChild(tr2, trs[0])
muchas gracias
saludos