manejar un servidor via msn???

.. me parece que no.. vamos por partes:
msn es SOLO un sistema de mensajeria instantánea, que además tiene juegos o alguna otra cosa. no sirve ni tiene nada que ver con lo que queres hacer.
por otro lado si no queres usar el Remote Desktop Connection que viene por default con window$, (que no es demasiado bueno), te recomendaría que utilices algun software como
VNC, o la solucion de Symantec, el
pcAnywhere
espero que sirva de algo.