Ok, para tu caso lo que debes hacer es utilizar o dejar el equipo encendido para que se ejecute esa tarea programada a una hora donde no lo esten usando.  Como no es un server, tendrías que calcular a que horas se puede ejecutar sin interrupción.  Digamos que a las 12:amam o 1:00am.
 
Para generar una tarea programada en win98, fijate en estos link: 
Programador de tareas Cómo programar una aplicación con el Programador de tareas  
Y para mayor información te dejo el filtro de 
Google 
Para tu caso podrías dejar otra tarea programada como una hora después para que apague automáticamente el equipo.