tienes que pegarla justo encima de ésta etiqueta (la embed) y la mismo nivel. Normalmente va entre las etiquetas <object> y <embed>, es decir:
<object tal tal tal lo que sea...>
<param lo que sea tal y tal...>(esto debería salirte)
<param lo que sea tal y tal...>(esto también debería salirte)
<param name="wmode" value="transparent">
<embed lo que sea que ponga aquí...>
Ahora yo tengo una duda:
¿Y para Mozilla y Netscape?¿Hay alguna forma de hacer que se vea el flash transparente?