Hola,
. : referencia al directorio actual.
.. : referencia al directorio padre del actual
Asi tienes que './fichero.php' hace referencia al fichero.php del directorio actual y '../fichero.php' al del directorio padre del actual.
PAra no mostrarlos, simplemente haces un if con esas cadenas. Y si solo quieres mostrar los ficheros puedes usar is_file() (
www.php.net/is_file) apra comprobar si el elemento es fichero o no.
Saludos.