Otro detalle ...
No sé si lo que quieres "codificar" es el código funete de tu script.php .. o alguna variable concreta .. (parece que es lo primero?)
En tal caso .. puedes probar "ofuscadores" como:
POBS
http://pobs.mywalhalla.net/
Eso "codifica" el código fuente de tal forma que se hace "dificil" el seguimiento del código .. pero no evita que sea "funcional" y que con "paciencia" puedan "decodificar" tu código fuente (php).
Un saludo,