Hola aleman:
No sé muy bien si te podré ayudar, porque no entendí bien la pregunta (bueno, creo que la has expuesto bastante bien, pero me extraña que no te funcione lo que has probado)...
Resumiendo, creo que lo que quieres es hacer un "reset" al formulario...
...
... en tal caso creo que sería conveniente llamar al método reset.
newwindow.document.forms[elFormulario].reset();
newwindow.focus();
Espero que te sirva.
Saludos
