Puedes usar la función:
 
register_shutdown_function() 
Ejemplo:  
 Código PHP:
    <?
function proceso_background(){
// tu proceso
}
 
register_shutdown_function('proceso_background');
?>    
  Con esa función vía HTTP lanzas el proceso y dejas a PHP que lo termine independientemente de que cierres la ventana de tu navegador. El proceso continuará. 
Un saludo,