Checate este artículo quiza te sea útil, explica como reconstruir una unidad desde el sector 0 donde reside el MBR sin utilizar fdisk /mbr, usando una herramienta llamada DEBUG que permite crear un programa para borrar los datos del MBR y dejar el disco como recien salido de la fabrica.
http://www.windowstimag.com/atrasado...mento/mbrs.htm 