Estás mezclando Javascript con ASP y eso no es correcto porque cada lenguaje funciona de manera distinta y se ejecutan uno el cliente y el otro en el servidor respectivamente.
Por tanto, lo que tienes que hacer es recoger el valor del campo de nombre al enviar el formulario, para que lo procese ASP y puedas usarlo. Más o menos así.
Código:
<%
usuario = Request.Form("NOMBREUSUARIO")
set FSO = Server.CreateObject("Scripting.FileSystemObject")
fso.createfolder (server.mappath(usuario))
%>
Fíjate que el nombre de la carpeta no tiene comillas porque lo que se introduce es una variable que en cada caso tendrá un valor distinto.
No sé si con esto te funcionará.
suerte.