Includes y buscadores

[damargon]

Hola a todos.

Me gustaría que alguien me comentase como funcionan los includes() con los buscadores.

Mis includes() son archivos .php almacenados en una carpeta del servidor,y dichos archivos son incluidos en una plantilla.

El buscador cómo hace la búsqueda:
¿Monta la página con plantilla+includes() y muestra el enlace a este conjunto? o ¿encuentra el texto buscado en los archivos que son incluidos mostrando tan solo ese archivo .php sin la plantilla?

Algo parecido me pasó con una web que monté con iframes, que al hacer la búsqueda encontraba los archivos con el texto pero sin montar en su respectiva plantilla. ¿Cómo se podría evitar este problema?

Espero haberme explicado bien.

Muchas gracias.