El manual de FPDF te dice:
Cita: FPDF([string orientation [, string unit [, mixed format]]])
habla de que tiene unos formatos predefinidos:
Cita: format
El formato usado por las páginas. Es puede ser uno de los siguientes valores (case insensitive):
A3
A4
A5
Letter
Legal
o un formato personalizado en la forma de un arreglo de dos elementos conteniedo el ancho y el alto (expresado en la unidad dada por unit).
Si te fijas .. dice que si usas un array con dos elementos: ancho y alto ya tienes tu formato predefinido en unidades expresadas en lo que "unit" defina (por defecto mm)
un array tipo:
array(30,40)
Código PHP:
$pdf=FPDF('P','cm',array(30,40));
Un saludo,
PD: Nunca he usado FPDF ..¬¬