Cita: - Que IDE me recomiendan?, una que se gratuíta y si es posible WYSWYG
Con PHP no "diseñas" tu página Web .. eso lo haces igualmente en HTML y si quieres con tu editor visual favorito (Dreamweaver o el que gustes).
PHP "dá" la salida HTML/javascript/etc que tu lógica decida. Puedes "incrustrar" PHP sobre HTML .. así que bajo esta filosofía podrías usar un editor HTML común con opción "PHP" que te ayudará en la sintax y algo más como por ejemplo el mismo Dreamweaver (a nivel "visual").
Cita: - Es posible ocultar los códigos?.
PHP se ejecuta en el servidor .. así que el código PHP própiamente dicho ya está "oculto" del cliente (navegador) que sería el HTML/etc que generes.
Otra cosa es a su vez "ofuscar" el código fuente PHP en el servidor ...
Cita: - Funciona solamente con Apache?
No, de hecho funciona como CGI en cualquier servidor HTTP: IIS, PWS, Xitami, etc ...
Cita: - Y por ultimo, tal vez la mas absurda, es cierto que existe una versión .NET?
Hay un proyecto (no recuerdo ahora el nombre) para sacar una versión de PHP para .NET, pero .. oficicialmente no hay versión .NET.
Un saludo,