Te haces un enorme lío para crear el <select> dinámicamente:
Código PHP:
<select name="listciudad" id="listciudad">
<? require ('configuracion.php');
$sql="SELECT municipio FROM municipios ORDER BY municipio DESC";
$result=mysql_query($sql,$con);
while ($row = mysql_fetch_array($result)) {
echo "<option value=\"".$row['municipio']."\">".$row['municipio']."</option>\n";
}
?>
</select>
Si quieres alguna "option" más por delante o detras de los que el resultado de la consulta SQL a tu BD genera .. tan sólo añadelo en HTML fijo:
Código PHP:
<select name="listciudad" id="listciudad">
<? require ('configuracion.php');
$sql="SELECT municipio FROM municipios ORDER BY municipio DESC";
$result=mysql_query($sql,$con);
while ($row = mysql_fetch_array($result)) {
echo "<option value=\"".$row['municipio']."\">".$row['municipio']."</option>\n";
}
?>
<option value="">NO APLICA</option>
</select>
Si el problema que tenías era como insertar algún elemento más al "option" de forma fíja como el ejemplo .. ya lo tienes resuelto, el resto de tu función javascript trabajar como si de un option HTML fijó (estático) se tratase.
PD: Observación .. Java != Javascript .. no mezcles cosas que sino, nos liamos ...
Un saludo,