Hola otra vez:
La forma que yo uso es sencillamente poner los objetos (imágenes, capas...) con un estilo básico: (style="position: absolute; left: 0px; top: 0px;" )... los valores left y top son los que sirven para mover las capas (cambiar las coordenadas), luego para hacer un efecto de movimiento, cambio las coordenadas con pequeñas pausas (setTimeout)
Si necesitas un ejemplo avisa.
Saludos