Vamos a ver: las relaciones las tienes que definir siempre, puedas definir o no las claves foráneas.
Me explico. El hecho de que no puedas definir una clave foránea, que es la forma expresa de indicar las relaciones, no implica que no tengas definidas las relaciones ya sea por medio de un campo que contiene la clave primaria de otra tabla o por una tabla que define la relación entre otras dos.
Mírate los artículos que se referencian en este
tema, seguramente te ayuden a aclarar más las cosas.
Un saludo.