Eso no se hace en JavaScript...
Para eso necesitas o un ASP o un PHP... Fijate aqui:
http://www.worldkit.com/wk_downloads.asp
Haz click en "Flash Files" y veras que el contador aumenta si haces click en un archivo, despues de refrescar la pagina, claro esta...
basicamente, lo que haces primeramente es jalar el contenido de una database, que dice cuantas veces ese click se ha activado... Al hacer click le das un "a href=" a una pagina que se vuelve a conectar con esa database y aumenta ESE numero en uno...
Al refrescar la pagina veras que el numero aumento en uno... :)