Primero: Lo lamento... estube metido en un desarrollo en Delphi por unos buenos dias y deje de lado todo el resto, por lo que no me habia metido en la red... sorry.
Respecto al problema, no entiendo!!! se supone que al decirle que la posicion es absoluta (position:absolute) y el borde superior este en 50 (top:50) ambos debieran aparecer en la misma posición...
Agregale bordes a las capas para efectos de prueba, de esa manera sabras en area que estan tomando,
OK, OK, OK, encontre el problema, el problema es mio, en vez de poner "position:absolute;top:50;" (como corresponde) escribi "position=absolute;top=50;" eso esta MAL.
de todas formas, para seguir con el argumento del párrafo anterior, puedes sustituir los DIVs por lo siguiente para ver los bordes:
<div id="divMerito" style="border: solid thin black; position:absolute;visibility: hidden; top: 50px;">
datos del div meritos
</div>
<div id="divPatente" style="border: solid thin black; position:absolute;visibility: hidden; top: 50px;">
datos del div patente
</div>
saludos