tienes el phpmyadmin (
http://www.phpmyadmin.net) si tienes instalado PHP en el IIS.
también tienes el mysql administrator, de MYSQL en
http://dev.mysql.com/downloads/administrator/
Si usas access, puedes crear una DSN y administrar las tablas desde access, vinculando las tablas (aunque no estoy seguro de ésto. sé que los datos los puedes manejar, pero no sé si puedes tocar la estructura).
Saludos