Para hacer eso tienes que cambiar el fichero ntoskrnl.exe ( o en su caso ntoskrnlsp.exe) original de windows.
Te recomiendo que busques información en Google por que es algo complicado y largo de explicar y puede darte problemas. Si lo haces guarda primero todos tus archivos en lugar seguro.
Primero debes sortear la función de Windows que protege los archivos del sistema para no ser sobreescritos. Para ello reinicia el PC y entra en modo seguro(F8).
El logo de tu empresa debe ser un autoejecutable que debes sustituir por el fichero ntoskrnl.exe o ntoskrnlsp.exe y debe llamarse igual.
Es algo complicadillo, si quieres hacer pruebas con otros logos que ya vienen configurados te recomiendo esta pagina:
http://www.themexp.org/listings.php?type=boot&view=date