No veo Roly porque tienes que iniciar tu aplicación lanzando el formulario principal, mejor es hacerlo desde un módulo que contenga el procedimiento main, por ejemplo asi:
Public Sub main()
' Presentación del formulario principal.
Application.Run(New frmLogin())
End Sub
Como ves lo primero que lanzas es el formulario login, asi no tienes porque estar haciendo invisible / visible los MenuItems del formulario principal!.