Eso deberás manejarlo desde el cliente con HTML/JavaScript.
Para ponerte un ejemplo ultra sencillo... voy a utilizar el tag <meta>:
Para la pregunta 4, deberás generar una etiqueta <meta> como la siguiente:
Código:
<meta http-equiv="refresh" content="60;url=http://tuweb.com/examen.php?pregunta=5">
Donde "60" es el tiempo en segundos de duración para la pregunta 4... y "5" es la pregunta que le sigue a la 4 ... ambos valores los lees de la BD.
El ejemplo es sólo para ilustrarte que lo tienes que manejar desde el cliente. No pretendo que tomes un examen serio con ese código. Podrías complicarlo más desde JavaScript para hacerlo más seguro.
Saludos