Puedes probar con esto:
www.mundodivx.com/varios/uniravi.php
¡Ojo! A veces se desincroniza a partir del punto de unión, asi que revisa el AVI unido. Otras veces es imposible unirlos.
De todas formas si vas a grabar en DVD tendrás que pasar primero a MPG y luego hacer una autoría, ¿lo sabes, no? El programa TMPGEnc DVD Author te permite meter en un mismo track dos MPG y los une automáticamente, por tanto otra opción sería pasar cada parte a MPG por separado y luego en el TMPGEnc DVD Author añades las dos partes en un mismo track.
Saludos