Normalmente, los gratuitos usan su propio hosting, entre otras cosas pq te meten publicidad.Tu has hablado en todo momento de alojamiento gratuito.
Si por el contrario, tienes alojamiento, hay otras opciones, como el propio blogger, Wordpress, Movable Type, Textpattern, b2 etc...etc... etc...Todos estos los puedes instalar en tu servidor, como dices tu, tipo phpnuke.
Cada uno tienes sus ventajas e inconvenientes, aunque por regla general todos necesitan PHP-Mysql para funcionar.
Yo te recomiendo Wordpress (
www.wordpress.org) ,es OS y tiene una comunidad muy importante detras, que esta constantemente en desarrollo y sacando mejoras, plugins etc..