Bueno, por lo k dices, tksko, tienes dos discos duros, asi k instalas win98 en uno y winXP en el otro.
Para informacion detallada consulta el siguiente tema
http://www.forosdelweb.com/f23/porque-unidad-c-tiene-preferencia-ante-las-demas-particiones-cual-motivo-249669/
Genial la explicacion de BrujoNic sobre la particion de 50 Mb
Suerte
Kmatx