Primero, lee esta FAQ de php para entender como funcionan las webs modulares:
http://www.forosdelweb.com/showpost....8&postcount=27
En cuanto a tu duda, creo que en el array pondrías esto:
Código PHP:
$conf['home'] = array(
'archivo' => 'carpeta/home.php',
'layout' => LAYOUT_DEFECTO );
saludos