Saludos...
 
Ahhh... ok, por ende estás utlizando dos variables, una para los segundos y minutos. Lo que quieres no es algo dificil. Deberías hacer algo como:  
Código:
 _root.onEnterFrame = function() {
   if(segundos==60) { //si los segundos llegan a 60
      minutos++; //incrementas en uno los minutos
      segundos=0; //y dejas los segundos nuevamente en 0
   }
};
  Eso deberías adecuarlo a lo que necesites (yo lo dejé pensando que las acciones las colocas en el frame)