Web Modular y CSS

[mon]

Gracias a javierB solucioné una duda que tenía acerca de como poner formatos distintos a distintas tablas usando identificadores, hasta ahí todo bien, el caso es que ahora al tener la web hecha de forma modular en php no sé como hacerlo para que obedezcan al css, lo tengo referenciado en todas las hojas, modulos, layaouts, inicio, etc, pero cuando cargo la página no le hacen caso y de forma individual si hacen caso al archivo css, alguien sabe como lo tendría que hacer? o donde debería de hacer referencia al archivo, probé a hacer un include del archivo.css pero logicamente lo que hace es sacarme todo el texto del .css, venga gracias de antemano o tal vez debería consultar en el apartado del php?