Fulltext y claves foráneas ó MyISAM Vs InnoDB.

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Hola amigos... estoy trabajando en una base de datos desde hace ya algunas semanillas, pasando un buen tiempo en planificar el modelo conceptual y cuidé la integridad referencial y por ello utilicé el tipo de tabla InnoDB, que según tengo entendido son las únicas que permiten trabajar con claves foráneas.

Pero oh! problema! Ahora me han pedido hacer un buscador y recabando información llego a la conclusión de que lo mejor es un fulltext... lo pruebo y HORROR!!!!! InnoDB no acepta no acepta este tipo datos!!!!!

Entonces que... ¿hay que tener un buen buscador pero una mala integridad referencial o viceversa? ¿Alguién puede decirme como hacer para hacer un buscador eficiente con tablas InnoDB o es una mera utopía?

Creo que este es un tema interesante que merece un intenso debate.

Ciao amig@s.