Novato: Estructuracion de mi web

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Hola, soy un novato en esto del PHP. Voy a realizar una pagina web y no voy a usar orientacion a objetos.

Mi idea es estructurar mi aplicacion en modulos auxiliares separados que se llamen entre si y paginas estaticas y dinamicas que utilicen las funciones y variables de estos modulos y generen el codigo html necesario, probablemente las librerias auxiliares esten dentro de algun subdirectorio que me imagino tengo que meter en el include_path.

Tengo algunas preguntas que a lo mejor parecen tontas pero en los manuales que he visto por ahi no me quedan muy claras:

1. ¿Cual es la diferencia entre

include("libreria.php");
y
include "libreria.php";
1B. ¿Existe algo parecido al fichero.h de C?
1C. ¿Que es el directorio /cgi-bin/? ¿Puedo usar mi propia estructura de directorios sin usar ese?

2. ¿Para variables globales DENTRO DEL servidor, uso $GLOBALS o $_SERVER?
2B. ¿Como se utilizan estos dos, teneis algun enlace de la web con informacion?

3. ¿O mejor utilizo un GLOBALES.php lleno de variables estaticas y luego hago include en todos los scripts?
3B. ¿Un array puede ser estatico?

y

4. ¿Qué variable me da el directorio raiz del sitio?

Perdon por preguntar tanto, he leido tutoriales y tal, pero esto no me ha quedado muy claro.
Gracias.