Si tu cableado soporta los 1000Mbps, el switch tambien, y la NIC (tarjeta de red) tambien, entonces no tendrás problemas. Siempre y cuando la tarjeta (y los demas componentes) efectivamente sea 1000Mbps
Para la maquina es lo mismo una tarjeta de 100 que de 1000
Disfruta tu red gigabit