Pero también puedes incrustar subtitulos en el avisynth, ¿no te sirve?
Simplemente es crear el AVS, y añadirle la linea:
TextSub("C:\unacarpetacualquiera\otramas\subtitulo .ssa")
Creo que necesitas tener el plugin textsub instalado pero no sé dónde ni cómo
Que acepten los VDR sólo conozco TMPGEnc.
Saludos