Si queres crear una tabla de MySQL usando codigo PHP tenes que hacer una consulta SQL lo harias desde la consola:
<?PHP
mysql_query("CREATE TABLE tabla (nombres de campos,caracteristicas)");
?>
ademas podes hacer cualquier consulta SQL de esta forma.
Para mas informacion tenes que buscar en el manual de Mysql:
http://dev.mysql.com/doc/ encontraras el manual en varios formatos.