Para calcular la diferencia entre 2 fechas haces lo siguiente, por ejemplo diferencia de días:
Código PHP:
//calculo entre 2 fechas
$dias= mysql_query("SELECT TO_DAYS(fecha1) - TO_DAYS(fecha2) FROM tabla WHERE id='$id'");
$calculo = mysql_result($dias,0);
echo $calculo;
como vez la clave es la función TO_DAYS de mysql (
http://dev.mysql.com/doc/mysql/en/da...functions.html)