Más que "estándares", son convenciones que utilizan los programadores para enterderse mejor. Cada uno decide ytiene su estilo de programación, pero desde luego que es mejor que sea todo convencional, asi el programador del lado te entiende sin preguntarte todo
Por lo demás, no conozco ningún tutorial/manual acerca de esto, creo que podrian existir; algo así como "Consejos de Progrmación PHP".
Saludos