-Un diagrama de procesos es aquel en el que tienes lso procesos y subprocesos (según el nivel del diagrama) así como sus entradas y salidas, aquí tenemos el diagrama de contexto (diagrama 0) y luego diagramas hijos (diagrama1, diagrama2, etc, cada uno se divide en otros y así sucesivamente) estos se hacen para diseñar o explicar los procesos de un Sistema. Mira aquí:
http://www.monografias.com/trabajos5/desof/Image712.jpg
Como puedes ver este es a nivel de Sistema
-Un diagrama de Flujo es donde planteas la parte lógica de un proceso o módulo específico( los ciclos, donde imprimes, donde capturas). mira aquí
http://www.monografias.com/trabajos12/diflu/diflu.shtml
Como puedes ver este es a nivel de proceso