Creo que hablas de lo que se conoce como "
artifacts". Generalmente son pequeñas manchas (de 1 pixel) que van apareciendo progresivamente (generalmente blancas o verdes).
Si es el caso entonces es probable que tengas problemas de sobrecalentamiento. En mi experiencia siempre he notado eso cuando la tarjeta de video se sobrecalienta y llega más allá de su temperatura normal de operación.
Revisa si tu tarjeta de video tiene sensor de temperatura y monitorealo con software como ATiTool o RivaTuner. Si no, no tienes más que el "dedo inquisidor", que consiste en tocar la parte posterior de la tarjeta de video (donde va el procesador de video) y sentir la temp tu mismo. Si quema o cuesta trabajo mantener el dedo ahí es que tienes trabajo que hacer al respecto.