tengo una aplicacion Web en donde en una de sus opciones el usuario tiene la opcion de subir fotos a un servidor Windows 2003, pero le tengo fijo el nombre del directorio donde se depositan todas estas fotos, ya van por 48 mil fotos y me han indicado que tener tantos archivos en un mismo directorio no es optimo, que tan cierto es esto y que me recomiendan. 
