.htaccess en 2 dominios

[radge]

Tengo un dominio que es http://www.ejemplo.com en un hosting de pago (dominio y hosting) y luego tengo otro dominio
que es www.ilernet.com que apunta al hosting de http://www.ejemplo.com .

El 1º dominio lo tengo en /www/
y el 2º dominio en /www/usuario/web2/


Para la primera web tengo el .htaccess con la siguiente estructura

Options +FollowSymLinks
RewriteEngine on
RewriteRule ^index.php/([a-zA-Z]+)/?$ index.php?s=$1



Y para la segunda , añadiria las siguientes lineas al .htaccess indicado
RewriteRule ^/web2/mod/([a-zA-Z]+)/?$ /web2/index.php?mod=$1
RewriteRule ^/web2/mod/busqueda/(.+)\.php /web2/index.php?mod=busqueda&nombre=$1


Pero esta segunda no hay forma de hacerlo tirar , veis donde me equivoco ?