supongamos que tu tabla mysql se llama miTabla y es algo parecido a esto:
nombre apellidos direccion email edad
y tienes un fichero llamado emails.txt donde estan los emails que quieres insertar en la tabla.
Pues en tu fichero php puedes poner lo siguiente:
mysql_query("LOAD DATA INFILE 'emails.txt' INTO TABLE miTabla (email)");
puedes ver el siguiente link en donde expliqué en otro post lo mismo:
http://www.forosdelweb.com/f21/pasar-archivos-texto-tabla-mysql-297496/
espero que te ayude