Según
esta tabla, ext2 (o ext3, que es lo mismo pero con Journaling) debería soportar archivos de 16 GB. SIn embargo, muchas aplicaciones no son capaces de manejar archivos de ese tamaño.
Prueba con wget (la versión de CVS ya maneja archivos grandes; no sé si las versiones empaquetadas de Fedora lo harán). O busca información sobre jigdo.
Algunas referencias:
https://www.redhat.com/archives/redh.../msg00284.html http://www.debian.org/CD/jigdo-cd/