Sabes Rootk, acabo de volver a probar con la funcion de JavaScript y la estaba ejecutando al hacer click en el boton con este codigo en html:
<span onclick="closeApp()">
<asp:Button id="Button1" style="Z-INDEX: 101; LEFT: 304px; TOP: 152px" runat="server" Text="Mostrar"></asp:Button></span>
y si funciona como quiero, lo malo es que yo necesito que funcione ejecutandola desde el codigo, y al ejecutarla en el codebehind con esto:
Response.Write("<script>closeApp();</script>")
Marca un error con el script y no hace nada:
Línea:1
Car:1
Error: Se esperaba un objeto