Yo digo que el uso de Access como base de datos sí puede reducir el rendimiento de tu Intranet si
a) Tienes muchos datos
b) Tienes muchos accesos.
Nuestro servidor estaba todo el dia con un TImeout, y fue migrar de Access a MySQL el 60% del contenido (no me ha dado tiempo a más, aún

) y no volver a ver uno.